پژوهشکده فرهنگ، انقلاب و تمدن اسلامی با هدف بررسی، پژوهش و تحقیق درباره موضوعات مربوط به تمدن اسلامی و چگونگی ارتباط آن با فرهنگ و انقلاب اسلامی تأسیس شد. نسبت فرهنگ و انقلاب اسلامی با تمدن اگرچه می­تواند به معنای بررسی تمدن اسلامی در گستره تاریخ گذشته باشد اما بیش و پیش از آن هدف این پژوهشکده تعیین چشم­اندازهای آینده تمدن اسلامی با تکیه بر آرمان­های انقلاب اسلامی است.

با چنین رویکردی بررسی ظرفیت­های تمدنی انقلاب اسلامی و همچنین دستاوردهای انقلاب اسلامی برای کشورهای اسلامی و ظرفیت­های تمدن­ساز فرهنگ اسلامی از جمله اهداف این پژوهشکده می­باشد.

بیداری اسلامی لازمه و مقدمه­ای برای رسیدن به تمدن اسلامی است به همین دلیل از جمله دیگر موضوعات مرتبط با اهداف این پژوهشکده بررسی موضوعات مرتبط با بیداری اسلامی است.

تحقیق و پژوهش درخصوص شخصیت­های تدثیر گذار در بیداری اسلامی در تاریخ ایران و همچنین تاریخ ملتهای اسلامی از دیگر اهداف این پژوهشکده می­باشد.

همایش ملی مرجع بیداری اسلامی به همت خانه مشروطه اصفهان و با همکاری پژوهشگاه علوم انسانی، شهرداری اصفهان، موسسه مطالعات تاریخ معاصر ایران، حوزه علمیه اصفهان و دانشگاه اصفهان روز پنج­شنبه مورخ  14/7/1390 با حضور شخصیت های علمی، سیاسی و فرهنگی برگزار شد. همایش مرجع بیداری اسلامی که به مناسبت یکصدمین سالگرد رحلت عالم ربانی آیت الله العظمی آقانجفی اصفهانی برگزار شده بود با پیام معظم رهبری و همچنین پیام آیت الله العظمی صافی گلپایگانی افتتاح شد.